SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002508_2.0
Identity
TranscriptIodothyronine deiodinase 2 (DIO2)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002508
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002415_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Full length Spliced 5UTR CDS 3UTR
Forward Reverse  
Sequence
>SPT00002508_2.0 # Transcript # Iodothyronine deiodinase 2 (DIO2) # Zebra Finch 
ATGGGTTTGCTAAGTGTGGATTTGTTGATCACGCTTCAGATCTTGCCGGTCTTTTTCTCC
AATTGCCTCTTTCTCGCGCTCTATGACTCTGTGATTCTGCTGAAGCACATGGTTCTGTTT
CTGAGCCGCTCCAAGTCTGGGCGCGGTGAGTGGCGGAGGATGCTGACCTCGGAGGGGCTG
CGCTGCGTCTGGAACAGCTTCCTCCTGGACGCCTACAAGCAGGTGAGTGCGCGGGGATGG
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GTTTAGGCGTGCCTCATTTCCCCCGAGCATGAATAATATCTTATGTTTTAAGGTATTTCA
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TTACACTGGCATTTTCTATTACTCATATGTAAACTTTCATATTGGAGGAAGTATCCAAGT
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TTGTGATATGGAATACCATCTGCTTTGCCTGAAACTCAAGCCATGGGGACATTAATTTTC
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GTTTTGCTGCTTCTGTAAGGAATAAATAGGAAAAAAGTTTCATCTGAAAAGTTCTACTGG
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AGCTGAAACCAGGTATTAGCAAATTACTTGAAAAGGTGCTTAAACTCATTCCACTGAGCA
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AACCACAGACAGACTGCCAGTTAGAACACTGAATCAAAGAAGTAACTGTGCTTGGTTTTA
CTGTGTTTTGTGTCACTTACACAGAATTTTTCCTGAGTACAGTTCATAATATTTTTCACA
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GTGGGTAGATACTACATTCTGAATTAAGGTAAACATATTACAAGAAAGTAGCTTGCCACA
AAAGCATGCATTGTCCCAGATTTATTTTTTCAAGGCTAGTGTGTAGAAGATATGATCTTG
TAATTGTTAGAGTATGTTTCAAACAAGCTATTCTGATTTACATTTTCATTGTCCTTATAG
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GTATATTCTGTGTTCTTTTTTATTGAAACATTCTGTATGACTGGTTTTCTCCACATTTTG
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CAGTGTTGATATTTTCTTCACTGCATCAGCTTTGTGATTTATAGACCATCCTATATTTTC
CAAGAGGCAAGTGTGTCTTACATTACAAGGGAGTCTTTAGGACCAAACTAATCATCATAA
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TGTTTTAAATATTATTTTTGTATATGTTTGTGTATGTAGGTATTTACAATTTTATATGTT
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CTCCCTATGTGCATACACATATATATGTGTGTATGTACACATACATACAGATATGAATGC
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AATTAAAAGCTTTTTTTTTTTTTACCTGCTAAGTTCTGTGCTTTATTTAGTAGTGGGATG
AATCTGTTTTCTAAGATACCAAAGGTGAGAAATTGTTATCTTAAAATGCTTTTAAAATAG
GTTAAAAAATGGTTGTACCCATTAGACATGCTCAGTGGTGAGCCCTTGTGCTGGAACCTT
TTCCAGTGCTAGATACGAGCTCTGTGTTTCAGCAAGCCAAAGCTATCATTCTTGGTCTCC
AGTAGAAGGCTTTAATGTTATCCTTGAGGAAATCATCCGTGTTCTCCACCTCAGTGTAGG
GTAGTCACAGGGAAGGCTTAATGGCCTCTCCCTGCAGCAGTCCAATAATTAGGAATGCCA
TGATGTACCTATAGGGCACGTGCACACATGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNTCTCAGGGAAAGGTTAATGGCCTTTCCTGCAACAGTCCAATAATTAGGA
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TGAGTCATGGTCTCAGAGGGATGCTGGTATCTCGAGTGAAGGATTGGTGGTAGGTTGTGG
GTACTGTACAGGGTGTTACTGTAAAAAAGAAAGGGCCAGCAGCAAGTTTTGGCATGACAG
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GGTAGCAGCAAGCAGAGTGGTTCAGTAAACACCCAGTGAGATTTTCCTGGGTTTTCATGC
AGGCAGTTAAATTACCTTTGGCTGCTTTTTCCTGCCTGGTAGGTAGATCATCTAAAATAA
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CAGCAACTCTTTGCATTTTGGGGAAATGTTTTAAAGGTTGAAACAAAGACACAATGTTCA
TACTTACTATTTGTATTTATTTAGTCCGGCAAGGTAAGGAAGTCTCTCTCTCTCTGCCTT
TGACAGTGATAAAGGGAATTTGAAAAAAAGTCTGTTGTATAATTTCAGGGTTTAGAACTA
GACATTGTGTGGTATTAAAAATATTTTATTGTTTTTACAAAGTTCAACTTTAGCAGGATT
GTTTTCATTGACATATGCAAATGAAAACAATCTTGAAAGAAGTGAGAAAAACAATAAACT
GAACCAAACCACAGTTAAAACTTCTCCTGCAAAGTTGGGAATGTAAATTCAACAGGATTT
GGTCTTGAAATTTTCTCATTTTCTCATTATTACTAATATATAATCATATTGTAGTTGTGT
CTGAGAATCAACCTAAGCTAGGGACCCATTGCACTAGACAGTGTCCCAACAAGAGGAGCA
GACAGCTGATCCCATGGAACGTAAGAGTTCAAACATTCAAGACAGACAGAGTAGAAAAAG
GAATATGAGGACTTTTGTCACACATGGGCTCTCATCCCCTTTTATTTTAGGGGATCAACT
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TGAGTAAAAAAAAAGAAAAAAAACATCATCCAAATTAATATCAAATTCCCTTCACAGGCT
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TTTCCTTGTGCATGCATACTCATTTGTGGGACTGGTGGCTTTTAAATGGAGAAAGCAGCA
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GAGCTCCACATACCTGATCTTAAATAAAAAACTCTGGGAAAGCCTGAGCCACTTCCAGTC
TCTACTCTCCAATTCAAGTAATTCAAGTTGCCATCTTCCCAAGAAAAATGAAGAACTTCT
GCACCCCTTATTCTACTGAAGACAAGGGTCTTCTGTGATTTTTGTCAACTGCACAACTCT
GGGTTATGAAATAAAGAAAACAAAAATAATAGTCTGCAGAATTTGCCAACCAGAGTTAAA
TTATGATTTGGATGTAACTATACGTAGCTGAATGGGATCAAATCAAGGCAGAGAATTTAA
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ACACAACATGCCCATATTCAAATGACTAATATCATAAACTGTTCATTGTCTTGCAGCCCC
TATTTTTTTTACAGGGTTGACACAATCTGATGAGTCTGCCAAACTGTATGAAAATCCCTG
ATGCAGGGAATTTAAGCAGCATTCCAGTGCACAGGAAGGTTATGCTGAAGCTGATAAAAG
CAAAGGAAAAAAGAAAAGGCAAATATGGGGACAATGTTTTGTCCGTGGAACTTTACCTAG
TTGTTAAGGAAAATGTACTACAAACTTAGCAGTGTGTGCTATTTCTAGCCTGCAGTTTAT
GAATAGAGCTTTCTCTCCTTCTCCTAAATCTCCTTCATTTTGCAGGCTGTGTGCTAAAAC
ATCAGCAATCTTGTTCCCTTTTCACTCTGCATGCAGACTAAGAACAGGCTGTCAGGCAAA
CACAAAATTCTCACAAATTATGTGAGTCACTGCTTTGGTGTAGCTGCTTGCCCCTGCTGA
TGGCTGGGCTGGCTTGCAGATTTGGTTGGCCTACCTTGTGTGTCCCATGCAGGCTGTGTG
GGAAGGGATGCCTGCGTGCTGCTCAGTTGCTACCTCATTCAGAACGCTGGCACCAAATGG
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CAAGAGCTATTTTTTCTTTCAATAAATAACAACAAAGAAGATGACCAAGGCCTACAATGC
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AAACAGTCCCTTGGGAACGTCAGTGCTTCATCAAGACCAATTAGTGGATCTGCGGCTGCT
GCTTATGTTCAGGCATTAACGACTGGGCAGGGCTGCTTTTTGGAGTGCCTGACACTGGCA
TGGAACAAGGCACCGACCTAATTACTTCTCTACAAGAGCAGAAAATGCCTCATGAATGCC
TGCTTGGCAAGGATGTCTCATTAAGGGGAAAAAACCCAACACAAGCACTCCTAGAAACAA
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GAGAAACTGCTGTAAGGTGATGTATAGTTGTATAGATGGATAAAGGCTTCTTTGTACTTC
GTTTCCTAACTCCATCTATTTTTATAGTCCATAAGGAGTATGAGAGGCAGAATGCAAACT
TGCATCGTTGAAGAACAGAACATATATTGTCATCTTTGCTATCAGTGTTAAATGGGACTT
GAAGAGTTGGTGTCTGTTGGAAGCTGTTTTATTAGTCTATTTCTTCAGGGTTTGCAAACT
GGCCTAGGAAACTAAAGGGTTTGGTAGACCTGAGTGAGGAATTGGTAATGAGGAGCTTAT
GATATATAGCCTCTCTTTCTGCTTAAAATGGTCAAGAAGGAAACTGTGGCTTCCCAGTTC
AAGAGTCATGGCTAGATATTTTCAGTCATGATAGTTTTGTTAAAATAAAACTTGAGGTGT
AACTAGAAACAGCTGCTCAGATGTTTCTTCGGTCCTAAGCACCTCTGTTCCTTCCTGACT
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CAAAATGTATTGTTTATTGGTGATTTGTGAGGTAAATGACATGCTATTACTTCTTTTCAT
TGACTGGATGAGCGCACACTCTTAAATACTGAGGCCCACTATTCACCTAGGGGGTTGGAT
GAAGCACAAATACTTACATGTCAGGCTTTGCCCAAAAGGCACATTTTCAGCAAGCTATCT
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GTGTTTGTGTAGATATGCATGTGTTGTGTTTTTTGAGATGCCCTTTTTGTGGTAGTCACC
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TTTACCTATCTTATGTCACACAATGGCAGAGAGAAATGATCAACAGTTGAATAGAAGACT
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CAAGGGCCTGAGTCTCTGAGCCTGCCTCTCCGGATGGATCATTTTTCTCAAAAACCTGGG
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CTGTAGTTCTCTTCCTTGCTGATCTCTGAGTGAGAATGGTGACATGGTTGTGTTACCATA
TGCCCTATTGGAAAGAGCCAAAATAATGCTCCTAATTGTGCGCCAACACGCTGTGAGACA
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GTTTCCTTCAAAGCAACAATTCTGAATGTAATCAAATAGGGGACAGAGAAAGAAAGAGTC
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CAGGGCTCATTCAAAATTAATTGCATTATGCAATAATGTTTTGTGGTTCTATAGTAGTTA
TCAGCTAATGATCTTGGAGACCTCTGCAGGCACCACCTTATTCTGCCATTCCCTCCTGTG
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CTTTTCCTGCTGTTATTTTTTTTCCCCCCAATCATCTTGTAAAGAAACATTGCAGTAGAA
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GAGCACAATCTTAAATAATTCATTGTCAAGGCAATGTATATATTAAGTGGGCATTTGCAG
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ATACACTAAGCTGCAAATCTCAAAAGTGAGAGGCACTGTGTGTGTTGTGAATTTCAGGAA
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TCTGTGAGCTACTTCATTATACAAATTGCAGTTGTTTGATTATACTGAAAATTAGTGAAA
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GCTATGTTTTAATTTGTTCTGCCATCAGGTCAAACTGGGAGGAGAAGCCCCAAACTCCAG
TGTAATCCACATAGCCAAGGGGAGTGATGGCAGTAGTGGCAGCTGGAAGAATGTTGGTGG
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GGTGGAGGAGTTCTCTGGTGTGGCTGACTTTCTGTTGGTCTACATCGATGAAGCTCACCC
ATCAGATGGCTGGGCTGCGCCTGGAATCTCTCCCTCTTCATTCGAAGTTAAGAAACACAA
AAGCCAGGAAGAAAGATGTGCAGCTGCTCACCAGCTCCTAGAGCACTTTTCCTTGCCGCC
TCAGTGCCAAGTGGTGGCTGACTGCATGGACAACAATGCAAATGTGGCCTACGGGGTTTC
ATTTGAGCGAGTATGCATTGTGCAGAGACAAAAAATTGCCTACCTGGGGGGAAAAGGCCC
CTTTTTCTACAACCTTCAAGAGGTCCGGCTTTGGCTGGAACAAAACTTCAGCAAAAGATG
AAATCCTTTCTCCACAGGAGTTACGTCAATCGATGTGTCCCTTTAAGGTGATGCAAAAGG
GAAAAAAAAAGGAAAGCATATGCTAGTTTTAAAAGAATCTTTCAGATGATTGCAGGAGAA
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AGCTCCACAGAAACATTGTCAAGTGAAAAAAAAAAATTGCACTCCTGCTCTTGCTATGGG
ACAGAAGAGATAAACAGACTTCTCCAAAAAGGTGCTGCTGGCAAGCAGGTAGGGTGGTTA
GATAAGACCTGAAGACCCAGACTGGGGTTTCCCAGAAGCCCCAGTCCTGGGGTGAGGCAC
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AATGCTTCTTTACCCCCTGTGGCCAATTCAAGGAACTTGAGAGGAGCAGGGGTTTTGCAA
TTGCTTTGCATACAAATGCAGTGCAGTGTGGTGATTTTCCTCTCTTGGTAGAAAATTTAT
TGTTCAGAGACTTCAGGAACCACATGCAGAATGGCACAGGCAGACTGGGTGCTCAGAGCA
AGATGAATCTTTGTCTGCAGGTGTTTGTATTCTCTGTAGACACATCTGCACAGCATATTA
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GGTGTTAAAATCTATTGAGTTGGACCAAAAAGATAAAGGTGATCAAATAAGCCCATTACC
ATTTGAAAACTGAAATATCTGGAGTAATTATAACACAACATTGAGAACCATCTAGAGCAT
GCACCGTGAGACAAAACTCAGCTGATGCTAACCAAACCTTGGTTCTGAGAGCTGACAACA
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TGTCTATCAATAGGATTAAAGGTAATTTCACTTTTAGCTTTAAGAAAATAACTTATTTCT
CTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGACCTTGAAGGTATATT
TTGGGGACAGGAGAACTTATGCACAATTTTACCTCATTGAAATGGAAACCTATTCTGTCA
TTTACCCTGTTAAATGTAGTCATGCTGACTTTTACTGTCTTAGATATCTGAACCTTGTTT
ATATCTATGTTAATTGGAAAGTTAAGTTGTTTTCAGTCTTAGAATTGATTAGCTACAGTT
CTGCTACTGGATGAGCTGATAGTCTGTTTTGCTCATATTCTTGAAAACCTTCCCAGAAGA
GAAACAGGGAGGACAAATAGTTTGAATTAATGTGAGTAAGTATAAAAGATGGCAAAATTT
TTATATGAATGATGATGAGGAATGGATTGTTATGTTGAAAGAGATACTGTGAACTTAGAG
TACACATTAAGTGTTTCTAAAATTAGAATTATTTAATCAAGCCTGATGAAGAGGCAGATT
TACAATGAGCTAACCTATTAGAGCTGATAAATGAAAACCCATATGGAGATGGACTATCCA
AGTTTTCTCTCATCTTTGGCAGAAATATGAAACAGATAACCAGAATAAGTGGCAAAAATC
AAATTAGTTCATAATTTCTCATCCTGCCCATCATCAGGAATATGATGTGTTGAGGCTGAC
ATAGAAAATATTAGAAAATACACAAGTCTTTTAATTTTCATAATGCCCACTAATATTGTG
TATTTCCTTAAGCTTGGCTCTTGGTCAACTTAGCCAATGTAGGAGGAATTTGGAAATGTG
TTTTCAAGCACAGATCTGAAATAATGACACTAACATGGGTAATTTCTCCCGTACCAGGTT
CATGCTTCCCATTCTTCTCACATTTTCCTCCACACACTGTTAAACATAGACACACATGCA
CTTACACAGTTGGTAATGTGCATTGGAGAAGGGTGTAAAGAGTAGTTGTCAGATGTCCCA
GTGAGCCCCACTTCTCAGAAGACCTGTGTCTCTCTGTGTGTGCATTTATATATGCATTCA
TACGTATATAATACATTTTTATGTATGTGTATATATATGTGTGCACATATAAATGGTGTC
TAAGACCACTAAAAATCATTATCCTGTCCTACCATTCATTAATGTTACTGTAAATTGTTG
CTCAATGCAGAAGACTTACAGATCTTCATGACTAACTGGGATATATAACTGAATTTTTAA
AACCTGTAATCATAGAAACAGTCACAAAGCCAAACTACATGGTTATTTAATCCAGTGTCC
TACCTCTGACTGTATCAGATGCTTCAGGGGAAGGTGCAATAATTTTAATTTAGAGAATTT
TTACTAGCTTCAGCCCATATTGTTTTTGCCTCATCTGAAGTGATTGTTGATGTCTCATTA
TCCCGCATGAGAGGCTGATTCTGGGTATTGAGATTAAAATATTTTGTGAGGTGGGGATTA
CTAAAATAAAAAAAGTCCCTCTTAATTTTAAAGAAAACCAAATGAAAACAGATTTTTTTC
TTTCATATTTAAATAGACTGCTTTTCAACATCATTCTCATCTCTTGCTGTTATATGCTAA
ACCACTAAACATAAGCGATCCCAATTTTTCTTCTGTATGTCAGTCACTATATAATCTATA
TAGAAATTTGCATACCTTTTGTTTGTTTAAGACAAACAATAACTCCTATTCTTATACAGA
TTCATACTCTTTCCTTGTCTCTGAATCACTTCTGTTTTTGCTACGCCGTCTTTTTACTCA
GGTGAGTAAAGATGTAGACATTAATCCAAGTGAAAATCTGTATTAATATACCCAGCACAG
AATCTTTTCTTTATTATATCCTGTTCTTCAGTCATCTGAAACTTTTTTAATCCATAGCAA
CTCCACAGCCTTTGTAAAACTTAAACTAGTAAGTCTTTTCTTCTTTTCATCATTATACTG
TAGAATTCTAAACTGTTTATATGGGAAATGCTAGCCAAATGTTTAACACAGCTGTTGAAA
CATACCTTTAGTTCAGAGGAAATAGTCAGAATTAGTAATTCAGTTTGTTAATACCCATTT
GCATATCTAAAGTTACAATTATTTTTCAAGTCCATTCTCTGCTTTTGAATTTCCATTATT
TTGTTTTGTCCTTCATAGATGCCTCTTCATCACGTAGTATACAGGAATTATAAAATTGGC
TCCTGTAAATGGGAAAAACAAATTGATTTTCCACAAATAAAAATGCGCAATAACTTCATT
TCTTTCTTGGCAACATGTATAACTGTCCTGCCTAAAATTTAAAGATATTCCAGCCTCACT
GATTATCAAGACAGAAATACATTTTGCAAAATCTTGGGTTTCCCCAGAAAACTCCCCAGC
AGGGCTTTCTTCAAAGTAAAATGGGCATAAAGGAAAAAAAAAAAAACCCTGGAAAAGTAT
TTTCTAGGAGGCTGACAGAAACATAATGTTTTATTTTGTTTGTTTGGGTTTTTTTTGTGG
TTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAAATCGAAACATTTCATT
GAAAAGGTTTTAAAAAAATATCCTCAATTGATAATAAAAGTGGCCATATGCCAGCTACCC
AAAATTATTATAACAGTTGTTTTGGGCCCTGGTAGAGATTTTATTGCTTTGCTAGACTTG
TCTAGTCTGCAGTGAGACTGGATTTGCTTCTATCTCATTCTCACTGTGCCAGGGCACTAT
ACCATATTACTTGAGGTGCTCCAGTGTGACATACATGTTGAGCAACAGCTCCCAAAATAG
GTGCCTGAAAGCATTCTGGAAGGCTACTGTATATAATAGAGACCCCAATACTGTGTCTCA
ACATTAGTATGGGAAACTTTCAGTATTTTTCATTTTGAGCAACATAAAAAGCTATTCTGG
GCTATCATTCTACATTGTTCTGTGCTTAGCATCTGTATTTAGCACTGTAGAAAAGTAATG
TAAAGCATTTTGTGCAAATGAGAAACTAGCATTTTGCTCTTTCCTTGTGTAGACAATGAC
ATAAATTTAAGGCAGCAGGAAAACATGCCCCATCTATTAAAAATAATAAAATATATTTAT
GAAATATGTTGTTGAACAACTGTCTGAACACTTTGAAAAACAAAATGCAGTGATTTTTAG
GAAGGTGATCTTGGTGGGGAAACCTACAACACTTCTTAAAAAGGTATTTGTGCTATGCAT
CCAGGTGTGTGCGGAGGGAAGTTATGTTTCTGCATGCGTGAAAGTGGCTTTTCTGTGATG
TGGAGTATAGATTTAAGAGTTTTTAAAACTTTAATTCAGTACTATAACCAAAGCAATAAA
AGGAGTCAGGTAGGGAATATTGGCCAGTTTTGTACAACTCGACACCATGTCTGTGACAAA
TCCATAATCAGTTGTGCCCAAATTGGAGTCTTCAGTGAAGAGGAATTGGGGTGAGACAGA
GGAAGCTTGTGTGCTCATGAAGATTGCTAACAAAAGAGTGATTAACTCAGTTAGCTTTCA
GATGCCTTCACGCTGGCA
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