SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000631_2.0
Identity
PromoterThioredoxin reductase 2 (TXNRD2)
SpeciesCiona intestinalis (Sea Squirt)
Promoter IDSPR00000631
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000566_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox Forward Reverse  
Sequence
>SPR00000631_2.0 # Promoter # Thioredoxin reductase 2 (TXNRD2) # Sea Squirt 
CCTATGAATTATGCGTGTAATGATTTTCCGCTCTGAAATTTACATGCATGAGTACAAAAT
CTACGCTTACCGATAAAATAAATGACATTCAGCGCGTTGTTTTGTCGTCGTTTAATTGAT
AAAACGATTGTAAATTAGAAAGTTACACCCGATTTTTGCGCGTTCTATCGGTAATTGTCT
CTTTCGCTTACTAGTTATTATCTACACACATTACAAAGCGCTTGCTCATTAGACGTGAAT
GCACCACGCGTTGTGTTAATGTTTGACCCAGACGCGAATTTTACAGAAATAACTGTGGAG
TCAGAATGATGCTGCCTTTTTCGCGGGTTCCGATTGGGCAGGATTTTGTAATGTCATGTT
GCGTCAGTTCTGCAAACTATGAATTGCGAAAGCGGTAATCACCGACCTAATCCGATATTG
TCCGATTCTCACGTTGGTTTCTTTTATTTTACGCATACTTTTTCTTTCTCTACAGCCGCG
CATGCTTTCTATTGGCTAATTATTGTGGGCGTGTTTTTTGCTAACATCACGCCCGCTTAC
CATTAAAAACCTTGTACGGTATTACCGTATTTACAGAGAAGCTACAGTGCTACACGATCA
TAAACTTAAAAGATGCTGCGTCAGGCGACTTCTAGTATTCTATCGCAATACTACACTAAA
GGAATAAAAACAACCTTCTTAGTTCGGCAAGCAAGTACTGCAATACCAAACGCCAACTCT
CATAAAGGAAAGCTTTCGGCTACCGAAATAATTGAGGTAAGCTGTCGTAAAAACTTCGGT
AAAGTTTGTTATGCAAAATTGTAGTACTAACCTAAGACATAGATGTTTGTTTTTTATACT
GTACACCCCTTATTTCCCTTGTTTTCAACTAATATTGTTAATAGTGAAACAAACCGTAGT
CACTGCCTTACCATCCAAGTACTGTTTGTCACACAAATCTTGCTGTTTATAAAGAGTTAG
ATAAAATCGGGTTAAAAGTTCAGTTCTGTACAATTATTAACTTACAAGTGTTTGTCATGT
CGAGTGCTCGTACAATGAAATTGAATAATGCTACATCACATTTTAAATATTTATGAGCAA
ACATAAAAATTATGGTTATTTCTATAATTCTATTGTATTTCATAGTTTAAAAATTATTTA
TCAAACATATAATCTTAATCACTAATGCATATAGATTTTATTCAAAACTTTGTCCTGTTT
TTTATTCCTTGGGCTTTGGGATAAACGGACATTAACGTGACAATTAAAAACAATGCTTTC
AAAAGCAACTTATCTTAATCTTATGAAACAAACATTATTAATGGAAGTATAGGGTAATAA
TACAAATACTAGTCATACAACTTAGATATTATGCAGTCTATATTTTCTGAGAAACCTCAA
CTTTTCCTCTTTTATCCACAAAAGCGAAATATCTCCTACAAACTTTTAACAGTCTTGTTC
CGAAGCTTTTCTTTTATAATTTATTATTTTTATTTAAGCAGTTGCTTTTAAACATAAGCT
TACCCGCAAATAACGTCTATTTGACTAAAAAGTCCCGAGTTTCATAACCTACATAAAGCA
CAAGAAGTAACCAGAGCATTACGCTTGGTCTAACTATACGGTAAACACTTTTGAAAATCT
AAATGACATTTTTGCTTTATCTAAACTAAATTCAGCAACATAATGATAAAAATCACCTGT
AACTAAACGGTCTTAACTTAAAACATAAATTACATCTTAAAAACAATGCTTATAAATTTC
ATTCATTCATACATCATCAGAAAATGTAGGCAGAGCTGTAAAAATCTTTTTTTATACATG
ATTACCTTTCTCAGTTAAATCGTTAATTAAATTAAAATAGTATATATACATACTGATACG
TAACTTTAAAATGAATTTTATCACAAAGTGAATACTGGTTGGGTTAGAAATAACAAAACA
GAAAAAAAAACACAGTTGTTTTTTACCCCTCTTCAAAAGGCATTTTAGAGTGAAAAAAAC
AAACGAAAAAAGTATGGAATGTTCGTAAAATTTAAAATTAAAATATACCAGCAACAGGGT
ACTTAAATATATAGAAAATACCTGCATTCCTAATAAATCTATTAAGAAAGACCTTCTTAC
AAAAAAAGTTTAGCAAACCTCATAAAAAGTTATTTGTCATATTTTGTTTGATTAAATAAT
TTGTGTTTTATCGAAAAAAAATTACCACCTAGAAGAACAGTTAGAATATAAAATAAGCCA
AATTAATGTCCCTTTTACCCACAAAAGCTGTTCGCGATAAAATGTTTTTTTAGCAGGCTA
GTAAGGTTGTCCTTTCTTCCCCCATTGTTTTTTATTACCCCACTTTACTGTGTATGTATA
AATCAGAATTAAATTTATTTTGATGAATTATAAGACTTTACTAACAGAACAGATTGATAT
GTACACTCTTAGTTATTAAATTCATTGTATATATAATTTGCCTTTCTTATCACAGAGGGA
ACGTCAGTATGGTGCGCATAATTACGACCCTTTACCAGTTGCCTTATCTGCGGGAAAAGG
TGTTCATGTGTGGGATGTGGATGGGAAGAAATATTTTGATTATTTGAGTGCTTACAGCTC
AGTCAATCAAGGACATTGTCATCCAAAAATTGTTGACGCTCTTGTGGTGAGAATTTATAA
TTTGGGTTTGAAACTGAAAGTAGTGCTTTTATAGTTTGGCCAAATACTTTTATTTAATTC
TAGTAATAATATATCAAGAAAGGATTAGTTTTAATACATTTTGTTGCAATTGCACTGGTA
AAGTAAAAAAATAATTCTTATAAAAAAGGATAACCCTCACAATCAATATGTGAAAATAAA
TATAAAAGTTAATATGCATGTTGATAGAGCCAAGCATCAACACTTGCAATCACTTCAAGA
GCTTTCTACACAGATGTGCTTGGAGAGTTTGAAGAATATATAACTAAACTCTTTAACTTT
GATAAGGTCTTACCCATGAACTCAGGTAATCATGTGCAGTATTGTTATAGCATAAAATAT
CGCAATTATTAAGTTATACTTTACACAGATTTGACAGAGAACGAATCAAATTCCTAATGA
AATAAATCAGTATATAACTTACACTTACTAAATGCTCATTATCAACTGGTTTTGAATCTG
TGAATCAGTTTTGATCTATTAAATGGATTACAGGTGTTTTATAAGACAATTCCAAGCTAA
ATGAATGTAATGAATAAATGTAACTTATTTTATCCTCACGTGGCCGGAAAACGACAGTCA
TTATCACATGGGTTTTACCTCTGGGTTACAGGCAGGCACACTAACCACTATGACACGGCG
CCAGACAAATAATAACTGAATGTTTATTGCAGGTGTTGAAGCTTGTGAGAGTGCATGTAA
GCTAGCTCGACGATGGGCATATGATGTTAAAGGTGTGCCTAACAACGAGGCACGGATTGT
GTTTGCTTCTGGAAACTTCTGGGGTCGATCACTTGCTGCTGTGTCTGCCTCAACAGATAG
TGACAGCTATGGGGGGTTTGGTCCATACATGCCAGGGTTTTCTATTATTCCTTACAATGA
CCTCTCTGCACTGGAGGTGTGTACTTCATCCCTTTTCATTGGTCTATAATAAAGACAATT
TATGGTGCGGTAATTAAACCATTCCAGCATATTTTAATGTATTTTTTTCCCTAAATTATT
TTGTTTATTAATATTAATGTTAAAAATTTAAAACTATTTTTTCATATTTGTTGCAAAACT
AGGTGGAATTAAAAAACCCGAACACAGCAGCATATATGGTTGAACCTATACAAGGAGAAG
CAGGGGTTGTTGTTCCCGATGAAGGATATTTACGAGGTGTTCGAGATTTATGCACCAAAC
ACAATGTGTTGTGGATAGCGGATGAGGTAAGAGTGGTTGACATAGTGTTTTAAATTTAAG
CTTTAACTTAAGTGGCACTTCATATGTGTGGATAATGAAGGGCAACAACAAATAAAATAT
ATTTTTCATCTGAATAATGTAAGGGAACACAAAACCATTTTCGCTCATGTAATATTAATG
ATAAAATAAAACTTAAGCAGCTCATTTAACAAGTGTACAAACACATTCTGTAGGTTCTGT
ATAATTAGGAGATAACTGGTTTGTTCAGGTTCAAACTGGTCTTGGTAGAACTGGAAAACT
CTTGGCATGTGATCACGAAAATGTAAGGCCCGATATCCTTGTTCTAGGTAAGTATTATAA
TGGTTTGTGTTCTGCAAATAGTGCTGTATATTTGAATATGTGATGTGGTTTCATTCTACT
TAATTAAAACAGGTCAATAATATTAAGAGTATTGTATTTTAATATAAGAGTATTGTATTA
AAATGTATGCCTAAAAATTGTACACAACAGTATGTGTGTTACTCTGCACAATAACACTTA
TTAATTTAAAAAAAAAAGGTTGATTTTTCTCAGGTAAAGCATTGTCTGGTGGTATGTACC
CTGTCTCAGCTGTGCTTGCCAGAGATGAGGTGATGCTGACTATAAGACCGGGTCAACATG
GATCAACGTATGGTGGAAACCCTCTTGGCTGCAAAGTGGCCATGGCTGCCTTGGACGTAA
GTTTTTGGAAATATATGTATATGGTTTTGCATGTTGTACTTAAGCTAGCACTTATTGTGG
AGCTACTGTGTTGCTTGATATGTGTTATTAGAAATGTTGCAAGCCAATTTTACATTGAGA
AACATGACACTGTAATATGATGACCCTTTGTTGTTATTTAATCATTGAATGTTTGTGTTT
GAGCTGCTTTTCCTTAATTTTACTGCTTAGGCAATAAAGGTTTACTTTTTACCTAACGGC
GATTGCCCCAATCCAGTGGTCACTAATGGGTTGTCTAAATTGTCAACAACACAATATAAT
AAAAAAATATATATAAAAAACAATTACCTATTAAGTTTGTAAGCGGGCATGAGGTGTATG
AAAACAGAACACCTATGTTATAAGTTAACGACTGTTGTTTACCGGTCACACAATGGTAAA
GCAAGTTACATTTAAAGTAA
Chart Advanced