SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000616_2.0
Identity
TranscriptGlutathione peroxidase 1b (GPx1b)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000616
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000520_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Full length Spliced 5UTR CDS 3UTR
Forward Reverse  
Sequence
>SPT00000616_2.0 # Transcript # Glutathione peroxidase 1b (GPx1b) # Zebrafish 
AAACATTTACAGTCCATCAGAAACTCCCCTCAGAAAAGGTTTTAGGAAGCATCTTCATTA
AGTAAACAGTGTAGAAAGCAGTGGCACTTTAATCATGACTGCACAGTCGGTCTATATCAA
ACTACAATCTTATTTTTAAAGCATGTGATGTGCAGTGGACGGTTTATCTTGCAAGAACAC
AACACGTAGAAGCCGCTGGTTTACTTGGTTCTCTTCAGAAGCTCTTTAATATCAGCATCA
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TGTAGACATGCTCATGTGAAACATTTCCCTCCCTTTTGTGATGCAGACCACTGAAAGCCT
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TGATTACTTAAAAGAACATGATAATTTATAAAATAAAAATAAAACATTTAAATGTAAAAT
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CATCATTGTATTATCAATAAGTATAATAATCCACATTGAAAGAACATTATTATTACAAAA
ACGCCAGAATGTAATAATTTAATAATTATTTAATGTAATAATACAGTTTATTAAAAATTA
TTTTAAATAACCAGATAAAATATTAAATCATAAATATATTTAAAACAATATATTAACTAA
TTGAATTAATATACCAATAACTTTTAATAAACATTGAACATAAAATATATTAATAACAAT
CATAAAATCTATAATTTACCCTGCATACATATTACAACTCATCACAGTGAACAAAAACTG
TTAAGTTAGCTGAAACATCACAGTCAACTGAAGACTGACCCCAGTGCAGCACTAAAGTCT
CACCTGGTGCCCGAACTGGTTGCAGGGAGCGCCCAGAACCACCAGCCCCTGGTCGGCGTA
CCGGCTGTGGAGCTCGTTCATCTGGGTGTAATCCCTGACTGTTGTGCCTCAAAGCGACGC
CACATTTTCAATCAGCACAACCTTTCCTTTGAGAGAGGAAAAATTCAGGAGATCTCCTGA
CAATAGTTTCGCGGACAGGTCGTAAAACTTCTTCATGGTTCCTGCCAT
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