SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000786_2.0
Identity
PromoterSelenophosphate synthetase 2 (SEPHS2)
SpeciesDipodomys ordii (Kangaroo rat)
Promoter IDSPR00000786
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000721_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox Forward Reverse  
Sequence
>SPR00000786_2.0 # Promoter # Selenophosphate synthetase 2 (SEPHS2) # Kangaroo rat 
TCACGCCGGCCTCGGCCGAGACAGGAGGCGGGGAGGAGAGAGAAGGCTTTCAAAACAAAA
ATGCTACTCGAGTTAGTGTGAAGTAACAGTCAGATATTACCCGAAGAGCTGGCTCCCTCA
CGCGGCCCGCGCGGCACGACCACAACGCGCGACTCACGCCACACCGGTGCCTTCCGGAGC
CAGAAGCCGCCGGCTTCCTGTATTTATAGAGACCTGGTGATTGACACACGCGCCATCCAA
TGAAGACGCTGCCCCCCCCCAGAGAGGCGTGCGCTTTCACTCCGAAAGGTGCTGGCAACT
GCCGGGTTGCAAAAGAAGATCCCGGCGGGGGTGGCGGGACGTCACGTGCGTCCCGTTCGC
TCGGCTTGAAATTTAAATGATCTCTCGGGAGTGGCGGGGACCGAAGTCCGGAATTCTTGC
AAGCGAAGGATGACTAAGTGATCTCGGCCAAGGTCGTTTGACCGCACACGAAATCGATCG
CGTAGGAAAACAGCCCTGGAGACACAACCCGAGAGATTAAAAAATTAGGTAACTGCGGTT
AAGGCAGCAAATGGCGACATCCACACAGCTCCACGACACTTCGGGCGGGAAGGTCGGAGC
CCCGGCTGGGCGCCGAGGGCGCTCGGTCTGCCACCCAGCGCTCTGTGTCACTCTCCCTCC
TCAGCATCAGTTCATTCCTCTGTGCAGTGGAAAACCTGACCTTATCTAGGTGCGCTCTTA
TTCAAGCTTCTGCACGTCTCTAAGTTTGATTTATTAATGTTTATTATCTAATGTTTATTT
AAAAAAATACACCTGGGCTGGGAGCTGGTGGCTCCCACCTGGAGTCCTAGCTACATAGGA
GGCTGAGATCTGAGGATCTCAAGTTCAAAGCCAGCCTGGGCTGCAAAAGTCAATGAGACT
CTTCTCTCCAATGAACCACCGCCATACCTGAAGTGGAGCTGTGGCTCCAGTGGTAGAAAG
CTAGCCTTGAACCAAAGGGTGCCATGACATAAAACAAAACAACAACAAAAAGAAAAACTC
TGCACAAAGTACTTTTGACCCAACAGTTCCAGTTCTAGAATTGTATCCAACAGTTCTATG
TATTTATTGTTGTACTGATTGCATTATCATCTTAATAACACGTTAAGTGCTTATCAATCA
TGATTAAACTAAATGATAGTGTTAAGTGAAGTAGGATGGATAGATGAGGAGACAGGGAAA
ATATATTATTTTCAAGAAATAGCAAAAGGTCCAGATTGAGAAGTTCAAACCAGAAGTGAA
CTGAAAAAAGCAACTAAGCTCACTTCCCACCATACCTACCTCCTTGTTAAATTACAAGGT
TAAGAGATATGCCTCTTTGAAATGGTAAAAATCTGAGAACTAGAGAGAAATATGGAAAGG
GAGACACTGATCAAGATGCATTGTACTAACAGATGGATGAATGGATCAAAAAAATGTGGC
ATATGCCAGGCATCAGTAGCTACTCAGGAGGCTGAGATCTGAGGATCATGGTTCAAAGCC
AGCCCAGGCAGGAAACTCTGTGAGACCCAGAAAACCAGAAGTGGCACTGTGGCTCAAGTG
GTAGAGTGCTTGCCTTGAGCTGAAGAGCTGAGGGACAGCATCCAGGCCCAGAGTTCAAGC
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CTCATCCATTAGAAAGAATGTTATTTGCAGAAAAATGGACAGACTTGGAAAAAGTATGTT
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GGAATTGAACCCAGGACCTCATGTGTGCAAGGCAAGCACTCTACCACTGAGCCACCTTCC
CAGTCCCACAACTGTAAATTCTTTACATATATTTACTAATTTAATTCTAAAAACTTTATG
AGCCAGAGGATGGCATCTCATGCCTTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGTTGAAATCTGAT
AGTGAAGGTTCAAAACCATCCCAGGCAGAAAAGTCCATGAGACTCATGTCCAATTAACAC
CCAAAAGCTGCAAGTGGAGGTGTGGTTCAATTGGTAGAGTGCCAGCCTTGAGCAAAAAAG
TGAGGTGAGCCAGGTGCTTGTGGCTCATGCCTGTAAAAAAAGAAGAAGCCAGGTGAGAGT
GAGAGACCATGAGTTCAAGTTCTAATACCAGCAAAATTGTCTTTTTTCTGGACCTGGGAC
TTGAACTCAGGGCCTGGGTGCTGTCCCCCCAGCCTCTTTGAACTCAAGGCTAAAGCTTTA
CTGCTTAAAACTCAGCACCACTTCTGGGTTTTTCTTTCTTTCTTTTCTTTTTGTCAGTCA
TGGGCCTGAACACTGGGTCTGGGCACTGTCCCTCAGCTCTCCAGCTCAAGGCTAGCGCTC
TACCATTGGAACCACAGCGCCACTTCTGGTTTTTTCTGCTTGGTGGTGCTGAGGAATCAA
ACTCAGGGCCTCATGCATGCAAGGCAAGCACTCTACCACTGAGCTATCTTCTGAGTAGTT
TATTGCAGATAAGAGTCTCACTGACTTTTCTGCCCCAGCTAGTTTCTAACTGTGATCCTC
AGACCTCAGGTTCCTGAATAGTTAGGATTACAGGTGTGAACTACTGGCACCTGGCTATAA
ATTTATTTTTAAAAGTAATTGAAGGAAATGAAAGATCACATCAAGCTTAGAGTCAAAACA
GGAATTCAACCTGCTCCAAAGACCAACTGGGTTAGGTTATACTGCTTATTATATATATAA
AGAGAAACAAGTCAACATTTTGCATGTATGTGAACCAGTATCGATGCATATGGCACCAGG
TATTGTTAAGAGGTACAGTCTTAGATGATAAAATTTGTTCAAAAGGCAAGAGAATGGGGG
CCAGGAATGTGGCTTAGTGGTAGAGTGCTTGACTAGTGTTAGCAAAATGAGCTCCCTTCC
TTAGTCCACGCCTTCCCTTC
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