SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000709_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U1a (SELENOU1a)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Promoter IDSPR00000709
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000644_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00000709_2.0 # Promoter # Selenoprotein U1a (SELENOU1a) # Zebrafish 
ATGGTTATTCCAGATAATATATGGGGAATGAAGTAGATGCCAAGCCAATAATACTTGCTT
ATAGAAATTGTATAATTTAATAGGAAGTTTAGAAATATTATAATTACATACTGGTAAAAA
GGAAGACCACCAACTTTGGGGAAAATATCCTTATGCTTGGCCTTGTTTGTTTACTACCTG
TAGATTCCTTTGAGGTGGCAGTCCAGACAGACGCGGACACGCCCATGTAATTAAAGAAGC
CTTTTCATTGGTGCACAACTGCGCGCCTCCCCTGCGTCAGTGCGTCAGCAGCGGCGGTTG
CCCTGGGAGCTCGCAGACACCGAAGTACACAGGCGGAGTAAAGACACACGGGCGGCGACT
TGCTCGCTGGAAATGGAACACAAGCAAACTGGTTTTGCAGTCGTTGGATAAAGAAAATTA
AATGACGTATTGTTGTCAAATCTACATGTAGATAGAGATTGATTGGAGGGCAGAAATGTC
TGCACAGCAGCACCGCTCGGTCCAACTGTCAGCCGCGTCTCTCGCTGTGGTTCTCTGTCG
GGACGAGGACAGCAAATTCAGCGCCAGCAGCACCAGCGGACAGGATGTGTTTGGGGATTT
TAGGTCTCAAAATTTGCGGAGCTTCTGGAATAAAAGACTCGTTAAAGCGGTGGCGGAGGT
TTCCTTTCAAGGATGGCTGGAGAACTACGTGCTCCTCGTGCAGGGCAATGCCAATAACTT
GGAGGTGTTGAGAGAAGCGTGGATGCGCCGTGCGCTGAGGTCACCCAAAGGATACACTAT
TAAAGCAGTGGGTAGGTGACCAGCATTTGGCTTTGTTTGCAAGGGTGTTAGAAAATGTGA
AATCAATGGGGTTCTCATTCATGAAGGATCGCAAAGATTTTTCTACAACTGGTTACTCTG
AAGATATGCCTGAACTTCTCGAGTGAGTCCCTCGAGAAATGTGAGAGAGACTTTGACTTC
CTGAAAATTGTATTAATTTAATTTGTGTATTTGTTTTTTTATTTATTGCACACCCACAAT
TATCTTTTCTCTATGACAAGGCATGTTGGATTTTTAAATGAAGGACATTCCTATGGTGCG
TCTATCTGGAGAAAAAAGTCTCTGAAAGGGTGACTTTTTTGGATTATGGTTGCAAAAATA
TTGAGGTAAAGTTTTATATTCGGACATTCTGACTTTCTTTTTAATAATATAGTTTCAGAA
AAGTATTCTTTGTAAATTCTGAATAGGAAAATCCTATTAGCAGCCAATGACTTATAAAGT
TCATCTTTGTTTACAGTTAATTAAATCGTGCTGATGTTTTTTAAAGTCATACTTAGATGC
GATTTCAGATCGAATATTCAAAGTAGCTGGGTAAACAATAAGGGAAGCTATTGTGTGAAT
GTAAAACCAACTTTACTTTAATATCTATTTATAAATCACATGAAAGCTGAATAAATAAAT
GTTTCATTGATGGAAGGAAAACAATATTTGGTTGAGATACTACTGTTTGGTAAATCTAGA
TTCAGAGGTTGCAAAAAATCTAAATATTGATAAAATCTCCTTTAAAGTTGCCCGAATAAA
GTTCTTTCTAATACAATTTTTATTAATAACAAAAAAAAATTAAGTTGTGATTTACTTACA
ACAGGGAATTTACAAAAAGTCCTAATGAAACATGTTCTTTCTTTAATGTTCTAATGATTT
TTGGCCTAAAATAAATGTTTTGACTGCATTTTTGGCTATTCCTACAAATATTTCCAGAAC
GAGAATCATTTAAGGATGACGTAAAAATACTTATTTAAGTCTCACTCTTTAAATTCTACC
TAATTATAATGAACAATTTTCACTGTTGTTTATCAGCAAAACACTTTTAATAATTTTGAA
TAGAATAACATTTTCATATGATTCTTTTATACATTTTAGTATTAAGCATGGGAAGATATC
ATCCTACGGTTTGCTAAAGTCAAGGTTTTAAAAACGCTAACATTTTCTGTAATACCGTTC
CTAAGGTATTTGTTATATATTTTATTTACTTTTTTTTAGGACAACAGTATATCCAGCAGA
AAAAAATATCCAAACATGCCATTTTAAAATGTAAAAATATCTGTGTTTTTTTAATCAAAT
GAAGACAGCTGAAGTCAATGATTCATTTAAATTATTTACTGCTCCAAAATAGTTATAATT
ATTCAAAAATAAAATTTGTTGTTTTCAAAGGAGAAAAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTACCCAGACATTTGAAAAGAATATATTTTGGAGCAGAAAACAATACCGTGA
TACAGTGAAACCGTGATATTTTTATCCAAGGTTATCACACCGTCAGAATCTTTTACTGAC
CCATGCTTAGTGACGGTATGATAACTGCTTACTGAACACTGATTACTGAACACAATACAT
TTTATTTTGAGAAACATTTAAAGTATTTTCGAATAGTAAACAAGTAAGGTGAAATAATTT
AAATGAATCATTGACTTGTTTGTCCTTTCTTCATTTGTTTCAAAACCACAGATTTCATTA
CAATTATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTTTTATTTT
TTTTACATTTTTTTTGGAGATACTGTTGTGCCGTAAAAAAACAGTGTGGTGAATGGTATA
ACAAAAGATTTTGGCGGTTTTAAAACCTTGACTTTTCCAAATCGTGGTATACCTTGAAAA
CAGTTAATGTCCCCTGCCTAGTCACAACATAATAATTGTGTTTTTTATAGTTTTTTTTTT
TTCATAAAATATCTGAATATACAATGTAGCATTACTTTACCTATGCCATCAATGACGTCT
ATTTTAACAAAAAGTTTTTTTCAAACAATACGTATACACTTTAATTGCATTCAAATTTAG
TTAAATATAAAATCACTTTAATTTAAAAATGTTTAAATTTTAAATGATTTGTCATTTTTC
TCTTTGACTGAAAGTGGCAAATTTAATAAAACAAAAAAACAAAACCTTCATTTGTGTCTG
TAGACATTGTCCCAGCAGATCTCTGTAGGGATGCACATACTCTATAGGCGATCCTCATAC
CCCAGTAACCTCTTGAATGCCTCTTCCTCCACTTTCTCTCAGATTGTTTTTCCCCAGCTA
TAATAGAAAACCATATAATTTCCGTTCGTTGTAGAAGGTAGCCTCTTAACCTAACCTGAC
CAACAATTCCCTATGAGACCTCAACATGCTTTAGGCGTAACTGTTTGCGTGCAACACAAC
TGCATTATTTCCAGATGACAGGAAATATGATTTCTGGGGAGCCGTGTAACCCTGCTCTCT
CTGTCTGACTCCACTTTCACTGCTCAGTTTCAGTTAAATCAGTTAACCTCCATAGAAAAA
AGAAATGGGGCATCTTGATTTGGTGTGGTTACAAAGTTCATTTTTAGTTATTAATGTGTT
TTCATAGAGGATGAAAAAAAATGTTTTCGTTGCTCACATGTTGAGGTGCCAGACCTTTTG
TGACAGTGTGGATTGTTGTTGCCTCAGGTGTGGCTGCTTCTGGGAGGCATCTGGTCTGCA
AAGTGCAAACATAAAGCAGATTGTGAGAACCACCATTTGCTCCTGCTGACTCAAGCGATG
AACGTGCATGCTAACAAACTGGGTGTATAGTGTGCAATATCTTTGCACTATAGGACGACA
CAACAGTGGGACCGGTGGTAGTAAAGGAGCTAAGACACAGCTTTCTTTTTTCGCTTGTGT
AATTTTCCCTTAGAAATTAAAAGCACACTTTCATATGCGTACCCTAGGGTTGAGACCTTA
GGTCAGGTGACGTAAGCCCAGCCCCAATGTCTTTGTAATTTATTACCCATTCACTGGAGC
CTATAGAATAAGTCATGTCCTGTCCAGTGACTGTCCACCAGTCAGGTTAATAGCTTGACC
AGTTCAGCCAATGTCCTTGTTTTATTCTCAGGGTATATGGCATAGAATCTATTGTTGTCT
GATGATGATGCTAGGACATTGGGTTGGCAACGCTTCTAAAGAAAATGTAGGTATGGTTTT
AATGAAACTATGGAAATGATAACCTTAAATAAGTTTCAAATAACCAGTGTTATTGTCAAA
TGTTAAATCATACTGGATGAACATCAATACCAATATACAACACTTCATTGGAGGTTGTCA
GATTTCTTGTTAAGACCTGTCTGTTGCTGTTGGTTTTGGCTTATTATTGCTGATTAAATA
TGAAATGTTGGTATTTTTCTTCAAAAAAATATCAAAGACTATTTTAAGCTAAAACTTTTC
TCCTTGGTTATTTATAATATTCAAGCCACTTGGATTTTGCGAATCACCAAGAACCAGATT
AACATGTTCTTAAATTCTATACTGAAGAAAACATCCAAATTATTTTTGGTTAAACTGTTT
CTTTAAAACCTTATTATGTGCTTTCAGTGCTTTGAATACTTTCAGTATTTTTCTAGGCCT
ATGTTTAGTCAGCAGGAACAGGTTAGTGGCTGTGATTACCCATCAGCAGATGGGATGATG
AATGAGCCTGCCTCCCGCTCTGTCCTCTTGATTATCAGTATACATTAAGTGAAAAGACGG
ATTGTTCACTGGGGTCTGCACTGTTTTTTTTTTTTACAGGGGCCTCTTGCCTGTGATTGA
CCTTTTCAGCTAGAATTTTGAGTCTTTTGTATGTTTTCTATAAACAGCACAAAATGTACA
TTGCATTAGACCAATTTTCTTAAGCTTAATGATAGGTACAAATTATTTAAAAAAATTGGT
CACTCGTCTTATTGTCATTCTATATAATTCTATACATTCTATAATATTCTCTTAATATTA
TATATAAAAACTCCTATAGGCTTTTGAAAATGTCTTTGTGGACCAGAAGTTCCTACAGAC
TTTACCTCAGTGTTGTTGTGTATTTCCGACTAAAACAGAATGCTGAACTGAGGGTGATTT
CTTTTTTTTTCTTTTTTTGCCTAAAGCTAAAGCCATAATGTTGAATTTATGTAATCAGAG
AACCTACTTTATTCCATCTT
Chart Advanced